シャトー・ジスクールの名が記載されている最も古い資料は、1330年にまで遡る。そこには、要塞化された城砦の中心の塔に関してだけ言及されていた。

ワインを生産していたことを示すものとしては、1552年、ジスクールのドメーヌが1000リーブルで売却されたことが記載されている。その当時から、ジスクールは良い良いテロワールを所有し、品質の高いワインを生産していたことで知られていた。1世紀の後、ジスクールのワインはルイ14世の王宮で飲まれていたという記録が残っている。

その後、何度も所有者は変わっていったが、中でも特に重要なのは1847年当時の所有者であったパリの銀行家のペスカトーレ伯爵だ。彼はウージェニー女王を招待するため、現在でも残っているシャトーを建てた。

その数年後に当たる1855年の格付けでは、高品質のワインを造っていたことが認められて、シャトー・ジスクールは3級に格付けされることとなった。

第二次世界大戦後、シャトーはニコラ・タリが購入し、徹底したシャトーの近代化に力を注いだ。

そして1995年、シャトー・ジスクールは現オーナーであるエリック・アルバダ・イェルヘルスマへと売却された。彼はブドウ畑および建物の改修のために、すぐに多大な投資を行った。今日も彼は、シャトーで良いワイン作りに取り組んでいる新しいスタッフと共に、かつての名声を取り戻すために努力を続けている。